El nombre del pueblo parece provenir de la palabra árabe Al-farnat, que significa molino de harina.
De hecho, ya aparece documentada la referencia a Alfarnate en el siglo X como zona de fuerte
producción de harina. En el vecino pueblo de Alfarnatejo todavía se pueden contemplar dos molinos
harineros que funcionaban con el agua del arroyo (en siglos anteriores de mucho caudal) y que dan
una idea de lo que era esta zona en aquellos tiempos.